Гиссарский государственный горно-арчовый заповедник расположен в Кашкадарьинской области на юго-западных отрогах Гиссарского хребта (1750-4421 м над уровнем моря).

Он имеет протяженность с запада на восток 37 км, а с севера на юг — 90 км, предназначен для охраны уникальных арчовых лесов и состоит из четырёх частей: Кизилсу, Танхаздарё, Мираки и Гилан.

Здесь обитают редкие и исчезающие виды: тянь-шаньский бурый медведь, белокоготный медведь, снежный барс, туркестанская рысь, среднеазиатская выдра, среднеазиатская кобра, бородач, снежный гриф, беркут, белоголовый сип, черный гриф, балобан, орел-карлик и другие.

Сам заповедник занимает площадь около 81 тыс. га и охватывает одну из самых глубоких пещер Центральной Азии — пещеру Амира Темура, участки с окаменелыми следами динозавров, водопад Сувтушар, плато Хазрат Султан, карстовое плато Кызылшавар, высокогорное плато Ходжакаршавар, высокогорные озера Джанка, каньон Каласай, Зармасский каньон, ледник Северцева.